Yaşar Üniversitesi Mali İşler Daire Başkanlığı, Üniversitenin Mali, Finansal, Bütçe iş ve işlemlerini; VUK, Vergi Kanunları, TTK, İş Kanunu, Yüksek Öğretim Mevzuatı, Vakıf Yükseköğretim Kurumları Yönetmeliği, Mütevelli Heyet Kararları, Yaşar Üniversitesi Yönetmelik ve Yönergeleri çerçevesinde gerçekleştirir. Bu işlemler, Daire Başkanlığına bağlı; Muhasebe Müdürlüğü, ve Finansman Müdürlüğü ile birlikte yürütülmektedir.